В Курганской области насчитывается более 3000 озер. Из них более 2000 пресноводные, а остальные имеют соленый или щелочной состав воды. Наиболее значимые и крупные:
| ОЗЕРО | район | рыба |
| Большие Штанки | Целинный район | карась |
| Большое Пашково | Петуховский район | карась |
| Большое Сливное | Мокроусовский район | гольян, карась, карп, щука |
| Индисяк | Далматовский район | гольян, карась, окунь, щука |
| Медвежье | Петуховский район | |
| Нифановское | Щучанский район | карась, карп, окунь, сиг |
| Ново-Песковское | Мишкинский район | карась |
| Нюхалово | Варгашинский район | гольян, карась, карп, окунь |
| Обменово | Варгашинский район | ротан |
| Окунево | Мишкинский район | гольян, карась, карп, пелядь |
| Паранино | Макушинский район | карась, карп, пелядь |
| Перейма | Частоозерский район | карп, окунь |
| Песковское | Далматовского район | карась, пелядь |
| Песчанное | Юргамышский район | карась, карп, окунь, ротан |
| Песчаново | Щучанский район | окунь, ротан |
| Песчаное | Шадринский район | гольян, карась |
| Песьяное | Лебяжьевский район | гольян, карась, карп, пелядь, щука |
| Песьяное | Макушинский район | гольян, карась, карп, налим, окунь, щука |
| Песьяное | Мокроусовский район | карась, карп, окунь, рипус, щука |
| Песьяное | Белозерский район | гольян, карась, карп, плотва, щука |
| Песьяное | Шатровский район | амур, карась, карп, окунь, толстолобик, щука |
| Писарево | Целинный район | карась, окунь, плотва, щука |
| Пичугино | Варгашинский район | карась |
| Половинное | Щучанский район | карась, окунь |
| Полой | Шатровский район | лещ, налим, окунь, судак, чебак, щука |
| Пьянково | Белозерский район | карась |
| Ременное | Варгашинский район | ротан |
| Речное | Целинный район | карась |
| Салазкино | Петуховский район | окунь |
| Салтосарайское | Петуховский район | карась |
| Светлое | Лебяжьевский район | гольян, карась, карп |
| Светлый Дол | Белозерский район | карась, ротан |
| Семискуль | Мокроусовский район | карась |
| Силино | Петуховский район | карась |
| Сметанино | Щучанский район | карп, окунь, ротан |
| Снегирево | Лебяжьевский район | карась, карп, окунь, судак, щука |
| Сотниково | Кетовский район | карась, карп, окунь, плотва |
| Становое | Целинный район | карась |
| Степное | Белозерского район | карась, ротан |
| Ступино | Каргапольский район | гольян, карась, карп, окунь, ротан, судак, щука |
| Таволжаное | Мишкинский район | гольян, карась, карп |
| Тайшино | Кетовского район | карась |
| Такташинское | Мишкинский район | карась |
| Теренколь | Макушинский район | карп, лещ, окунь, судак, чебак |
| Теренколь Горький | Макушинский район | карась, лещ, окунь |
| Турналыколь | Альменевский район | карась, окунь, пелядь |
| Угловое | Шумихинский район | гольян, карась, щука |
| Филиппово | Половинский район | карась, карп, окунь, ротан |
| Фуртик | Целинный район | карась |
| Хохловатики | Кетовский район | карась |
| Чаша | Каргапольский район | ротан |
| Чесноково | Мишкинский район | карась, карп |
| Чистое | Кетовский район | амур, гольян, карась, карп, толстолобик, щука |
| Шадринское | Частоозерский район | карась, карп, окунь |
| Штаново | Сафакулевский район | карп |
| Щучанское | Юргамышский район | гольян, ерш, карась, карп, окунь, судак, щука |
| Щучье | Шумихинский район | карась, карп, окунь, щука |
| Щучье | Мокроусовский район | карась, карп, рипус |
| Щучье | Варгашинский район | карась |
| Яровое | Половинский район | амур, гольян, карась, карп, окунь, плотва, толстолобик, щука |